L'église Saint-Jean Baptiste est aussi appelée Cathédrale Saint-Jean ou encore Primatiale Saint-Jean. La Cathédrale étant l'église de l'archevêque et celui-ci étant le Primat des Gaules, la cathédrale de Lyon porte donc le nom de Primatiale des Gaules.
La construction de la Cathédrale a commencée au XIIeme siècle par la manécanterie (mur de clôture). Les pierre de la primatiale provienent de plusieurs endroits, certaines ont été prélévées sur des voies romaines, d'autres tombaient de la colline de fourvière et enfin une partie provenaient des carrieres environnantes. Les tailleurs de pierre étaient situés sur la place saint-Jean.
Entre 1165 et 1180, l'abside, les deux chapelles latérales ainsi que le transept ont été construit dans un style roman, la voûte de l'abside puis du transept sont dans un style gothique.
Au XIIIeme siècle, les deux tours orientales, les 4 premières travées de la nef et leurs voûtes sont achevées ainsi que les verrières du choeur avec les rosaces du transept.
Les 4 dernières travées, la partie inférieur de la façade sont achevées au début du XIVeme siècle. La rosace de la façade principale pris place en 1392. La façade et les tours seront terminées au XVeme siècle. Une statue de Dieu le Père sera placée au sommet du pignon en 1481.
Le style de la Cathédrale Saint-Jean n'est pas purement gothique. Ce style composite lui nuit, elle ne figure donc pas parmis les plus belles cathédrales.